二元论（dualism）是本体论的一支，和一元论相对立。它是主张世界有意识和物质两个独立本原的哲学学说，强调物质和精神是同等公平地存在的。二元论实质上坚持意识离开物质而独立存在。哲学史上典型的二元论者是17世纪法国哲学家R.笛卡尔。他认为，意识和物质是两种绝对不同的实体，意识的本质在于思想，物质的本质在于广袤；物质不能思想，意识不会广袤；二者彼此完全独立，不能由一个决定或派生另一个。事实上两者都存在着差别。

二元论把物质的派生物精神当作完全脱离物质而独立的东西，因而不能科学地解决世界的本源问题。同时，由于它违背了科学所证明的基本事实，故也不能真正将物质与精神绝对独立的原则贯彻到底。笛卡尔为了说明物质实体和精神实体的来源，不得不承认上帝是“绝对的实体”，无论物质实体，还是精神实体，都得依赖于“上帝”。这样，他的二元论最后还是倒向了客观唯心主义的一元论。

笛卡尔

此外，任何将宇宙或某种东西分为两个独立部分的观点也可称作二元论。例如柏拉图的理念—事物二元论，康德的本体—现象二元论以及宗教二元论。其中宗教二元论最为常见，他们认为世界由两种力量统治：善与恶。善是精神，是灵魂，是善的力量创造的一切东西；而恶是物质，是肉体，是恶的力量创造的一切。这两种力量对抗著，共同支配世界。“善的力量”和“恶的力量”，在严格二元论者（如摩尼教）眼中，分别是两个神，一个善的神，一个恶的神。他们地位等同，力量相同。而温和二元论者（如塞特派）认为，只有一个上帝，即善的力量。而恶的力量，是比上帝稍微低一个档次的路西法，力量也次于上帝。

摩尼教

而人类也被这两种力量所支配——善的灵魂，恶的肉体，灵魂藏在肉体之中。如果恶属性的肉体在较量中占优势，那么这个人就会被肉欲所支配，变成“恶”的人。如果善属性的灵魂占优势，那么这个人就会成为“善”的人，也即是上帝的子民。

从“恶”变“善”，要通过苦修，祷告等方式，把灵魂从肉体中洗涤出来。 不过与其他理论不同，基督宗教公认的二元论，人的灵与肉体的感受高度结合，所以也有称为灵与魂，其中人的魂附属于灵，但是又通过魂的对灵意志的影响把从肉体来的感受在灵里反应给灵。