种子说（英文：doctrine of seeds）是指古希腊阿那克萨哥拉关于与物质结构有关的本源学说。他认为构成万物的细小微粒是种子，种子的性质与事物的可感性质相同，事物有多少种性质，构成它的种子就有多少类；数目众多的一类种子构成事物的一种性质或一个部分。

阿那克萨哥拉深受伊奥尼亚学派唯物主义思想影响，但他又不满足于用某一种具体物质或元素作为万物本原的主张，因为这不能解决一和多的关系问题，于是他提出了自己的种子说。种子说以多元的物质本原改造巴门尼德的“存在”，用粒子化的物质结构来革新和发展伊奥尼亚哲学的本原说，由此阐明自然的本原和现象的统一。

阿那克萨哥拉

该学说肯定种子的无限多元性，认为它在宇宙开初混沌中就永恒存在，未分化时就包含着分化成无限多种事物的可能性，即从无限求无限，由无限生无限。

这一学说肯定了种子和物体的可以无限分割性，每种东西都是既大又小的。因此不仅宇宙，每个个别物体在数量上和空间上也都是无限多倍的无限；事物同时既大又小，因此具有间断和连续的二重性。由于种子的大小是不确定的、无定形的，所以它既不会被分割到零成为绝对的非存在而不复存在，也不会成为一种数学上抽象的、不可再分割的几何点。这就孕育了后来数学上的微分观点。

种子说认为种子包含着万物的成分，任何一个种子都可以无限分割，但无论分割到多小，它仍然是种子，仍然包含着分化为万物的因素，因此大小的东西所包含的成分在数量上是相等的；种子既然可以无限分割，它本身又包含着万物的一切成分，因此种子本身就是间断性和连续性、“一”和“多”的统一体。

就其意义而言，种子说是从恩培多克勒的元素说（四根说）向原子论过渡的桥梁。